在东京的东都线地铁开通当日，发生了一起针对东京都知事朝仓优一郎的炸弹袭击事件，导致东都线列车遭到损毁。经过推理，柯南、灰原、少年侦探团以及毛利小五郎等人认定此事与8年前朝仓负责的北之泽水坝的修建有关。为了揭开真相，他们前往北之泽。在那里，少年们结识了曾经一起长大的好朋友，山尾溪介、远野瑞希、立原冬美等人。然而，他们似乎也有着某种秘密和芥蒂。这是《名侦探柯南》第15部剧场版的故事情节。