明修学苑理事长樱井凉子（黑木瞳饰）带领她的团队前往湘南，宣布明修湘南高中的成立。该校副校长是内山田广志（田山凉成饰），而鬼冢英吉（AKIRA饰）则担任2年级A班的副班主任。同时，弹间龙二（城田优饰）和冴岛俊行（山本裕典饰）也回到了湘南，与曾经一起在那里惹事生非的坏孩子们重聚。鬼冢和高傲女教师藤川穗奈美（比嘉爱未饰）合作打理2年级A班，而新生代宫地明里（三吉彩花饰）、宇佐美太一（佐野玲于饰）、芹泽航平（龙星凉饰）等人，尽管看似活泼享乐，但都有自己的身体和心理创伤。GTO鬼冢再次展开行动，以独有的方式帮助学生们解决问题。该片改编自藤泽亨的同名漫画。